Il clima di Mikonos è molto simile a quello dellealtre isole cicladi ed è quindi tipicamente mediterraneo, con dolci inverni ed estati secche e calde. Da Aprile fino ad Agosto, il tempo è sempre soleggiato. L’isola ha un bassissimo livello di precipitazioni e per questa ragione si usano depositi d’acqua per sopperire ai bisogni della popolazione e dell’alto turismo.
L’estate è un ottimo periodo per visitare l’isola e Giugno, in particolare, è un mese molto mite.
Il clima è stabile e le temperature si aggirano intorno ai 28° C – 30° C, anche se il termometro è noto a salire molto più alto quando il tempo è particolarmente soleggiato, anche se il clima ventilato può avere un effetto di rapido raffreddamento. Le notti sono calde, ma di solito non creano disagio.