Il giardino Shinjuku Gyoen è sede di un gran numero di alberi di ciliegio di diverse varietà. Dalla fine di marzo ai primi di aprile, più di 400 alberi Somei Yoshino fioriscono intorno al giardino inglese e trasformano i prati in una delle più popolari e piacevoli macchie Hanami di Tokyo.
Inoltre, il parco ha numerosi ciliegi che sono ricchissimi per la stagione dei fiori di ciliegio che inizia da metà marzo a fine aprile per coloro che amano questo periodo dell’anno e vogliono goderselo fino in fondo.
Shinjuku Gyoen è anche bello da visitare durante l’autunno, quando le foglie cambiano. Ci sono un sacco di diversi tipi di alberi che cambiano i colori intorno al parco, ma gli aceri sono particolarmente belli e possono essere visti in gran numero in tutto il giardino giapponese e Momijiyama (acero di monte) sul lato orientale del parco.
I colori compaiono tipicamente da metà novembre a metà dicembre.